南通沿海有三个主要知名的渔港：启东吕四国家级中心渔港、如东小洋口（洋口国家中心渔港）和如东刘埠一级渔港。吕四和小洋口是国家级中心渔港，等级更高，而刘埠则是三个港口中规模较小的。南通每年捕捞的野生海产品约为23万吨，其中大部分来自吕四，其次是小洋口，这里是江苏海货上岸的主要地区。捕捞的鱼类种类繁多，销路各异，最常见的是带鱼，其次是小黄鱼、银鲳、梭子蟹、梅童鱼和鱿鱼。梅童鱼在当地被称为梅子鱼，与小黄鱼有亲缘关系，体型小，颜色金黄，肉质鲜嫩，几乎不含刺，属于近海野生品种，难以人工养殖。带鱼的捕捞量大，大部分被冷冻加工，很多销往韩国；而小黄鱼和银鲳则主要供给上海、苏州等长三角地区的餐厅和菜市场。梭子蟹在开渔初期非常抢手，优质产品被配送至全国各地，梅童鱼和小杂鱼大多被当地小贩收购，供给街边小店出售。

渔获上岸后的分流大致有两条路。约六成的新鲜海鲜通过冷链运输在24小时内送往上海、苏州等长三角的大市场，之后再分销至东北、福建、四川等地的菜市场和餐馆。其余四成则送往本地的加工厂，进行冷冻或制成蟹肉、腌制海鲜，其中一部分供国内消耗，另一部分则出口至韩国。本地消费者所占的比例相对较小。开渔季时，码头非常热闹，外地渔船也会前来吕四和小洋口卸货，这使得渔港的交易量超过当地渔船的捕捞量。小贩和冷库商也能够获取货源。开渔时，渔船靠岸后现场报价收货，小老板可选择收购小批量的鱼，并将其冷冻成品慢慢销售。然而，品质较好的大批量货物往往被大型批发商和厂家优先抢购，小贩们通常只能拿到普通或尾货。在收购海产品时，必须遵守规定，禁止收购幼鱼和非法捕捞产品，休渔期间更是严禁收购违规海货。

刘埠渔港位于如东栟茶北边的刘埠村，许多人容易将其与海安的新北凌闸混淆。刘埠码头比吕四和小洋口要小，主要是本地渔船卸货。沿街的小店和摊贩卖的海鱼来源较为复杂，有的是从吕四、小洋口或刘埠的商贩手中获得，有些来自当地农产品批发市场，也有的来自近海捕捞的小渔船。此外，还有一些淡季时从冷库中解冻的货物。在休渔期，摊贩不得出售非法捕捞的野生海鱼。面对部分海货出口韩国，不少人会感到诧异，认为韩国自身有丰富的海鱼资源。然而，由于长年捕捞，海洋资源逐渐减少，产量无法满足国内需求，加上水产加工厂数量众多，韩国大量依赖进口冷冻原料鱼。南通渔港出口至韩国的多为冷冻鱼原料，而非新鲜海鲜。在开渔季节，南通的各大海产渔港总是热闹非凡，空气中弥漫着海鲜的鲜香味道。